Het bestuur fungeert als toezichthoudend orgaan en bestaat uit zeven leden. Voor de selectie van bestuursleden wordt een profiel gehanteerd, waaraan in het geval van vacatures naar behoefte specifieke eisen worden toegevoegd. Er is één bestuurslid benoemd uit Vlaanderen (op basis van afspraken rond samenwerking met het Vlaams Bijbelgenootschap). Eén bestuurslid wordt benoemd na voorafgaande goedkeuring door de Ondernemingsraad. En één bestuurslid wordt benoemd op voordracht van de regionale ledenvergaderingen om de rol van het vrijwilligerswerk te benadrukken. 

Voorzitter

Dr. G.H. (Henk) van de Graaf, voorzitter
Emeritus-predikant Protestantse Kerk in Nederland.
Benoemd in 2003
Herbenoemd in 2008
Nevenfuncties: Geen

Penningmeester

Dhr. G.F. (Fred) Ruiten, penningmeester
Accountant
Benoemd in 2006
Herbenoemd in 2011
Nevenfuncties: Voorzitter Christelijke Scholengemeenschap Jan Arentsz Alkmaar. Penningmeester Gereformeerd Primair Onderwijs West-Nederland.

Bestuursleden 

Prof. Dr. F.R. (Rudy) Van Moere (vanuit Vlaams Bijbelgenootschap)
Hoogleraar Oude Testament en Hebreeuws, Faculteit Protestantse Godgeleerdheid in Brussel.
Predikant Eglise Protestante Libre in Brussel.
Benoemd in 2008
Herbenoembaar in 2010
Nevenfuncties: Geen

Ds. S. (Sybout) van der Meer
Emeritus predikant Doopsgezinde gemeente Haarlem.
Benoemd in 2008
Herbenoembaar in 2013
Nevenfuncties: Bestuurslid Habitat for Humanity Nederland. Voorziter World Vision Nederland. Bestuurslid Internationaal Menno Simons Centrum. Voorzitter Advisory Board Mennonite Central Committee Europe/Middle East.

Mw. Ir. D.D. (Diana) van der Stelt-Scheele (met goedkeuring OR)
CFO/CTO Nieuwe Voedsel- en Waren Autoriteit
Benoemd in 2009
Herbenoembaar in 2012
Nevenfuncties: Lid Raad van Toezicht Evangelische Omroep

Dhr. W. (Wiep) Koehoorn (op voordracht van het landelijk beraad)
Sr. Beleidsmedewerker Corporate Office Quality Assurance, Stenden Hogeschool
Benoemd in 2010
Herbenoembaar in 2014
Nevenfuncties: Vereniging VU Windesheim: lid ledenraad, voorzitter regionaal Comité Fryslân, en voorzitter benoemingsadviescommissie Raad van Toezicht.
Voorzitter bestuur Stichting Jabikspaad Fryslân (pelgrimspad).
Lid Landelijk Comité 'Tsjernobyl 25 jaar later'

Mw. A. (Anne) Westerduin
Eigenaar Sestra Media B.V.
Benoemd in 2011
Herbenoemdbaar in 2016


Het bestuur wordt bijgestaan door een commissie Financieel Economische Zaken, die begroting en jaarrekening voorziet van een preadvies voor het bestuur.

Toezicht

De Commissie Wijffels heeft in 2006 het advies ‘Code Goed Bestuur’ opgesteld. Hierin staan normen voor de inrichting en het functioneren van goed bestuur van goede doelen organisaties. Het NBG-bestuur heeft de afgelopen periode ruim aandacht gegeven aan deze Code. Ook het uitkomen van het nieuwe CBF-keur en het aantreden van een aantal nieuwe bestuursleden hebben in 2008 aanleiding gegeven om de structuur van toezicht houden en besturen nog eens kritisch te bekijken.

Een meer helder omschreven taakverdeling tussen bestuur en directie, en wijzigingen in de regionale structuur, hebben geleid tot aanpassing van de statuten in juli 2009. 

Ledenraad

De ledenraad fungeert als extra toezichthoudend orgaan, en vergadert minimaal één keer per jaar. De ledenraad ziet erop toe dat het Nederlands Bijbelgenootschap handelt in overeenstemming met de statutaire doelstellingen.

Daarnaast heeft de ledenraad een aantal formele bevoegdheden: benoeming en ontslag van bestuursleden, het vaststellen van statuten en goedkeuring van het jaarverslag.

De leden van de ledenraad worden gekozen door de leden op de regionale ledenvergaderingen (op voordracht van bestuur en landelijk beraad) De ledenraad bestaat uit 31 leden, waarbij het bestuur bij de voordracht streeft naar een evenwichtige verdeling van kerkelijke achtergrond.